En general, la povidona iodada és més segura que el iode i, en alguns casos especials, el iode pot ser més segur d'utilitzar.
En general, la povidona iodada és més segura que el iodòfor. La povidona iodada és un complex d'ions d'oxigen i iode, el que fa que sigui menys irritant per a la pell i les mucoses i més adequat per a un ús a llarg termini. El iodòfor, en canvi, és una solució de iode que té un efecte irritant important sobre la pell i les mucoses. L'ús prolongat pot provocar al·lèrgies a la pell i altres problemes.
Tanmateix, en determinades circumstàncies especials, el iode pot ser més segur. Per exemple, quan es requereix desinfecció de la pell, els metges poden recomanar l'ús de iode, ja que la povidona iodada pot provocar reaccions al·lèrgiques o irritar la pell.
Cal tenir en compte que tant si s'utilitza povidona iodada com iode per a la desinfecció, s'ha de seguir el mètode d'ús i la dosi correctes. Si s'utilitza de manera inadequada o excessiva, pot provocar reaccions adverses o problemes de salut. Per tant, el millor és consultar a un metge o professional abans d'utilitzar qualsevol desinfectant.